Il s’agit de l’un des plus importants monuments religieux de la ville de Porto. L’église Saint-François (Igreja de São Francisco) est une église franciscaine datant de 1245. D’origine plutôt romane, elle bénéficie également d’un style gothique et d’une décoration baroque. A l’intérieur de l’église se trouvent trois nefs, toutes ornées de boiseries dorées à l’or fin. Dans l’une d’entre elles est placé « l’arbre de Jessé » : une sculpture en bois polychrome parmi les plus belles du monde.
Dans le sous-sol de l’église se trouvent des catacombes où sont enterrés de nombreux Franciscains ainsi que certains nobles de la ville. Les catacombes de São Francisco renferment également un ossuaire contenant des milliers d’os à observer à travers un sol vitré.